vtpnet

DOI:10.18129 / B9.bioc.vtpnet

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅vtpnet。

variant-transcription factor-phenotype网络

Bioconductor版本:3.8

variant-transcription factor-phenotype网络,灵感来自Maurano et al .,科学(2012),PMID 22955828

作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“vtpnet”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“vtpnet”)

PDF	R脚本	vtpnet: variant-transcription factor-network工具
PDF		参考手册

细节

biocViews	网络,软件
版本	0.22.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.0.0),图,GenomicRanges,gwascat,doParallel,foreach
进口
链接
建议	MotifDb,VariantAnnotation,Rgraphviz
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	vtpnet_0.22.0.tar.gz
Windows二进制	vtpnet_0.22.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	vtpnet_0.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vtpnet
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ vtpnet
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/vtpnet/
包下载报告	下载数据