此包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本,请参见毒蛇.
Bioconductor版本:3.8
从基因表达数据推断蛋白质活性,包括VIPER和msVIPER算法
作者:Mariano J Alvarez
维护者:Mariano J Alvarez
引用(从R中,输入引用(“毒蛇”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.5”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“毒蛇”)
R脚本 | 使用毒蛇 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | FunctionalPrediction,GeneExpression,GeneRegulation,NetworkEnrichment,软件,SystemsBiology |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.14 (R-3.1)(5年) |
许可证 | 文件许可 |
取决于 | R (>= 2.14.0),Biobase、方法 |
进口 | mixtools,统计,平行,e1071,KernSmooth |
链接 | |
建议 | bcellViper |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | aracne.networks,火神 |
进口我 | diggit,diggitdata,研制,RTNsurvival |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | viper_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | viper_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | viper_1.16.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/viper |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/viper |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/viper/ |
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