毒蛇

DOI:10.18129 / B9.bioc.viper

此包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本,请参见毒蛇

基于丰富正则分析的蛋白质活性虚拟推理

Bioconductor版本:3.8

从基因表达数据推断蛋白质活性,包括VIPER和msVIPER算法

作者:Mariano J Alvarez

维护者:Mariano J Alvarez

引用(从R中,输入引用(“毒蛇”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“毒蛇”)

PDF R脚本 使用毒蛇
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews FunctionalPredictionGeneExpressionGeneRegulationNetworkEnrichment软件SystemsBiology
版本 1.16.0
在Bioconductor公司 BioC 2.14 (R-3.1)(5年)
许可证 文件许可
取决于 R (>= 2.14.0),Biobase、方法
进口 mixtools,统计,平行,e1071KernSmooth
链接
建议 bcellViper
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 aracne.networks火神
进口我 diggitdiggitdata研制RTNsurvival
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 viper_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 viper_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) viper_1.16.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/viper
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/viper
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/viper/
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