的作用

DOI:10.18129 / B9.bioc.uSORT

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅的作用。

作用:self-refining订购基因选择的管道

Bioconductor版本:3.8

这个包的目的是发现内在细胞从单细胞RNA-seq发展路径数据。它包含了数据预处理、初步PCA基因选择、初步的细胞排序,特征选择,精细胞排序,后分析解释和可视化。

作者:陈麦刘、陈郝Jinmiao陈

维护人员:陈郝< chen_hao在immunol.a-star.edu.sg >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“作用”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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细节

biocViews	CellBiology,DNASeq,GUI,ImmunoOncology,RNASeq,软件
版本	1.8.1
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3.0), tcltk
进口	igraph,矩阵,RANN,RSpectra,VGAM,gplots平行,plyr、方法、集群,Biobase,fpc,BiocGenerics,单片眼镜、grDevices图形、属性、跑龙套
链接
建议	knitr,RUnit,testthat,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	uSORT_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	uSORT_1.8.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	uSORT_1.8.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/uSORT
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/作用
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/uSORT/
包下载报告	下载数据