TrackTables

doi:10.18129/b9.bioc.tracktables

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅TrackTables

构建IGV轨道和HTML报告

生物导体版本:3.8

在HTML页面中创建复杂的IGV基因组浏览器会话和动态IGV报告的方法。

作者:汤姆·卡罗尔(Tom Carroll),桑杰·卡达(Sanjay Khadayate),安妮·帕琼(Anne Pajon),Ziwei Liang

维护者:汤姆·卡罗尔(Tom Carroll)

引用(从r内,输入引用(“ TrackTables”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ TrackTables”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ TrackTables”)

PDF R脚本 使用TrackTables创建IGV HTML报告
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 报告写作,,,,测序,,,,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(4。5年)
执照 GPL(> = 3)
要看 R(> = 3.0.0)
进口 iranges,,,,基因组机,,,,xvector,,,,rsamtools,,,,XML,,,,拖拉机,,,,Stringr,,,,rcolorbrewer, 方法
链接
建议 尼特,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 TrackTables_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 TrackTables_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) TrackTables_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tracktables
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/tracktables
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/tracktables/
软件包下载报告 下载统计

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