srnadiff

DOI:10.18129 / B9.bioc.srnadiff

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见srnadiff．

小RNA-Seq的差异表达

Bioconductor版本:3.8

不给予参考注释时小RNA-seq的差异表达。

作者:Zytnicki Matthias [aut, cre]

维护者:Matthias Zytnicki < Matthias。Zytnicki在inra.fr>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("srnadiff")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“srnadiff”)

超文本标记语言	R脚本	装饰图案的标题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，DifferentialExpression，表观遗传学，GeneExpression，ImmunoOncology，预处理，SmallRNA，软件，StatisticalMethod
版本	1.2.1 "
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(一年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5)
进口	Rcpp(>= 0.12.8)，方法，utils，devtools，BiocStyle，S4Vectors，GenomeInfoDb，rtracklayer，SummarizedExperiment，IRanges，GenomicRanges，DESeq2，Rsamtools，GenomicFeatures，GenomicAlignments，ggplot2，BiocParallel
链接	Rcpp
建议	knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	srnadiff_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	srnadiff_1.2.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	srnadiff_1.2.1.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/srnadiff
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/srnadiff
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/srnadiff/
软件包下载报告	下载数据