剪接物

doi:10.18129/b9.bioc.bioc.splices

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅剪接物

一个用于探索RNA-seq数据对齐差距位置的生物通用套件

生物导体版本:3.8

对RNA-Seq数据进行剪接中心分析。

作者:Wolfgang Kaisers

维护者:Wolfgang Kaisers

引用(从r内,输入引用(“剪接岩”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ splicesites”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“剪接岩”)

PDF R脚本 剪接物
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,基因表达,,,,蛋白质组学,,,,rnaseq,,,,软件
版本 1.30.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(5。5年)
执照 GPL-2
要看 方法,rbamtools(> = 2.14.3),Refgenome(> = 1.6.0),生物酶,,,,生物弦(> = 2.28.0)
进口 生物基因,,,,多比,,,,seqlogo,,,,iranges
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Splicesites_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 Splicesites_1.30.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Splicesites_1.30.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splicesites
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:套餐/拼接的人
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/splicesites/
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