snapCGH

DOI:10.18129 / B9.bioc.snapCGH

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见snapCGH．

aCGH数据的分割、归一化和处理。

Bioconductor版本:3.8

aCGH数据的分割、规范化和处理方法;包括用于可视化单个和多个数组的原始和分段数据的绘图函数。

作者:迈克·l·史密斯，约翰·c·马里奥尼，史蒂文·麦金尼，托马斯·哈德卡斯尔，娜塔莉·p·索恩

维护者:John Marioni < Marioni at uchicago.edu>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“snapCGH”)

PDF	R脚本	分割概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation，微阵列，预处理，软件，TwoChannel
版本	1.52.0
在Bioconductor	BioC 1.8 (R-2.3)(13年)
许可证	GPL
取决于	limma，DNAcopy、方法
进口	aCGH，集群，DNAcopy，很高兴，图形，grDevices，limma，方法，统计，tilingArray,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	ADaCGH2
建议我	beadarraySNP
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	snapCGH_1.52.0.tar.gz
Windows二进制	snapCGH_1.52.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	snapCGH_1.52.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snapCGH
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/snapCGH
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/snapCGH/
软件包下载报告	下载数据