这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见siggenes.
Bioconductor版本:3.8
利用微阵列显著性分析(SAM)和经验贝叶斯微阵列分析(EBAM)鉴定差异表达基因和估计错误发现率(FDR)。
作者:Holger Schwender
维护者:Holger Schwender < Holger。SCHW在gmx.de>
引文(从R内,输入引用(“siggenes”)
):
要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("siggenes")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“siggenes”)
R脚本 | siggenes手册 | |
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,ExonArray,GeneExpression,微阵列,MultipleComparison,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 1.56.0 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 14年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | 方法,Biobase,乘,样条,图形 |
进口 | stats4 |
链接 | |
建议 | affy,注释,genefilter,KernSmooth,scrime(> = 1.2.5) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | KCsmart |
进口我 | 魅力,coexnet,DAPAR,DeSousa2013,GeneSelector,minfi,XDE |
建议我 | GeneSelector,logicFS,三人组 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | siggenes_1.56.0.tar.gz |
Windows二进制 | siggenes_1.56.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | siggenes_1.56.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/siggenes |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/siggenes |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/siggenes/ |
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