芝麻

DOI:10.18129 / B9.bioc.sesame

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅芝麻。

工具分析Illumina公司英飞纳姆DNA甲基化数组

Bioconductor版本:3.8

工具分析Illumina公司英飞纳姆DNA甲基化数组。

作者:周扫读(aut (cre),回族沈(aut),盖Triche(施)

维护人员:扫读周< zhouwanding gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“芝麻”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“芝麻”)

HTML	R脚本	芝麻用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation,MethylationArray,预处理,质量控制,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5),sesameData、方法
进口	R6grDevices跑龙套,illuminaio,质量,GenomicRanges,IRanges、网格preprocessCore统计数据,S4Vectors,randomForest,wheatmap,ggplot2平行,DNAcopy
链接
建议	尺度,knitr,rmarkdown,testthat,minfi,SummarizedExperiment,FlowSorted.CordBloodNorway.450k
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/zwdzwd/sesame
BugReports	https://github.com/zwdzwd/sesame/issues
取决于我
进口我	TCGAbiolinks,TCGAbiolinksGUI
建议我	sesameData
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	sesame_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	sesame_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	sesame_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sesame
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/芝麻
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sesame/
包下载报告	下载数据