这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅seqPattern。
Bioconductor版本:3.8
想象寡核苷酸序列模式和主题出现在大量的序列集中在一个共同的参考点和按用户定义的排序功能。
作者:Vanja Haberle < Vanja。在gmail.com haberle >
维护人员:Vanja Haberle < Vanja。在gmail.com haberle >
从内部引用(R,回车引用(“seqPattern”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“seqPattern”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“seqPattern”)
R脚本 | seqPattern | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | SequenceMatching,软件,可视化 |
版本 | 1.14.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(4年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | 方法,R (> = 2.15.0) |
进口 | Biostrings,GenomicRanges,IRanges,KernSmooth,plotrix |
链接 | |
建议 | BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7,篮球选手,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | 平行 |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | genomation |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | seqPattern_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | seqPattern_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | seqPattern_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqPattern |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ seqPattern |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/seqPattern/ |
包下载报告 | 下载数据 |