seqLogo

DOI:10.18129 / B9.bioc.seqLogo

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅seqLogo。

DNA序列比对的序列标识

Bioconductor版本:3.8

seqLogo需要位置权重矩阵的一个DNA序列的主题和情节的相应序列标识引入施耐德和史蒂芬斯(1990)。

作者:奥利弗Bembom

维护人员:奥利弗Bembom <奥利弗。在gmail.com bembom >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“seqLogo”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“seqLogo”)

PDF	R脚本	DNA序列比对的序列标识
PDF		参考手册

细节

biocViews	SequenceMatching,软件
版本	1.48.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(12年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	方法、网格
进口	stats4
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	generegulation,motifRG,rGADEM
进口我	感兴趣,motifRG,PWMEnrich,rGADEM,riboSeqR,spliceSites,分裂,TFBSTools
建议我	BCRANK,DiffLogo,Logolas,motifcounter,universalmotif
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	seqLogo_1.48.0.tar.gz
Windows二进制	seqLogo_1.48.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	seqLogo_1.48.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqLogo
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ seqLogo
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/seqLogo/
包下载报告	下载数据