scsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.scsR

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scsR。

SiRNA校正种子脱靶效应介导的

Bioconductor版本:3.8

纠正了全基因组siRNA屏幕种子脱靶效应介导的。合适的函数来确定有效的种子/ microrna并可视化效果也提供的包。

作者:安德里亚•弗兰切斯基尼

维护人员:安德里亚•弗兰切斯基尼< andrea.franceschini isb-sib。ch >,罗杰Meier <罗杰。在lmsc.ethz迈耶。ch >,基督教冯仅仅<仅仅在imls.uzh.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scsR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“scsR”)

PDF	R脚本	scsR装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	预处理,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.14.0),STRINGdb、方法、BiocGenerics,Biostrings,IRanges,plyr,tcltk
进口	sqldf,哈希,ggplot2、图形、grDevicesRColorBrewer
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	scsR_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	scsR_1.18.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	scsR_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scsR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scsR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scsR/
包下载报告	下载数据