rhdf5

DOI:10.18129 / B9.bioc.rhdf5

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见rhdf5．

HDF5接口到R

Bioconductor版本:3.8

这个包提供了HDF5和r之间的接口。HDF5的主要功能是能够通过完全可移植的文件格式在大容量存储(磁盘)上存储和访问非常大和/或复杂的数据集和各种各样的元数据。rhdf5包因此适合于在R和其他软件包之间交换大型和/或复杂的数据集，并允许R应用程序在比可用RAM更大的数据集上工作。

作者:Bernd Fischer [aut]， Gregoire Pau [aut]， Mike Smith [aut, cre]， Martin Morgan [ctb]， Daniel van Twisk [ctb]

维护者:Mike Smith < Mike。史密斯在embl.de>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("rhdf5")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rhdf5”)

超文本标记语言	R脚本	rhdf5
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，基础设施，软件
版本	2.26.2
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 14年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.5.0)，方法
进口	Rhdf5lib(> = 1.3.2)
链接	Rhdf5lib
建议	bit64，BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/grimbough/rhdf5
BugReports	https://github.com/grimbough/rhdf5/issues
全靠我	GenoGAM，GSCA，HDF5Array，HiCBricks，LoomExperiment
进口我	beachmat，biomformat，bsseq，CoGAPS，cTRAP，diffHic，DmelSGI，DOQTL，DropletUtils，EventPointer，gep2pep，h5vc，电离，phantasus，PureCN，司康饼，紧身的
建议我	刨边机，激流回旋，SummarizedExperiment，tximport
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rhdf5_2.26.2.tar.gz
Windows二进制	rhdf5_2.26.2.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	rhdf5_2.26.2.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rhdf5
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rhdf5
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rhdf5/
软件包下载报告	下载数据