该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅区域人。
生物导体版本:3.8
Erineer提供了一个基于可自定义置换测试的统计框架,以评估基因组区域集与其他基因组特征之间的关联。
作者:Anna diez-Villanueva
维护者:bernat gel
引用(从r内,输入引用(“区域者”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ recienter”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Zirener”)
html | R脚本 | 区域人小插图 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | chipseq,,,,库务,,,,dnaseq,,,,遗传学,,,,甲基,,,,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(4年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 基因组机 |
进口 | 备忘录,,,,基因组机,,,,iranges,,,,BSGENOME,,,,生物弦,,,,rtracklayer,并行,图形,统计,utils,方法,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 核粒子 |
进口我 | Annotatr,,,,Chippeakanno,,,,核粒子 |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | riester_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | riender_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | riender_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regioner |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/区域员 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/regioner/ |
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