区域人

doi:10.18129/b9.bioc.Bigioner

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅区域人

基于置换测试的基因组区域的关联分析

生物导体版本:3.8

Erineer提供了一个基于可自定义置换测试的统计框架,以评估基因组区域集与其他基因组特征之间的关联。

作者:Anna diez-Villanueva ,Roberto Malinverni 和bernat gel >

维护者:bernat gel

引用(从r内,输入引用(“区域者”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ recienter”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Zirener”)

html R脚本 区域人小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 chipseq,,,,库务,,,,dnaseq,,,,遗传学,,,,甲基,,,,软件
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(4年)
执照 艺术2.0
要看 基因组机
进口 备忘录,,,,基因组机,,,,iranges,,,,BSGENOME,,,,生物弦,,,,rtracklayer,并行,图形,统计,utils,方法,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我 核粒子
进口我 Annotatr,,,,Chippeakanno,,,,核粒子
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 riester_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 riender_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) riender_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regioner
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/区域员
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/regioner/
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