rSFFreader

DOI:10.18129 / B9.bioc.rSFFreader

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rSFFreader。

rSFFreader设定触发器文件中读取由罗氏454生命科学离子激流测序

Bioconductor版本:3.8

rSFFreader读取序列,品质和夹点值设定触发器文件由罗氏454和生命科学离子激流测序fastq文件也存在类似的类。

作者:马特落定< mattsettles gmail.com >,山姆猎人,布莱斯•萨维尔,髂骨Zhbannikov, Kyu-Chul曹

维修工:马特落定< mattsettles gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rSFFreader”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rSFFreader”)

PDF	R脚本	介绍rSFFreader
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,测序,软件
版本	0.30.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	ShortRead(> = 1.23.17)
进口	方法,Biostrings,IRanges
链接	S4Vectors(> = 0.13.8),IRanges,XVector,Biostrings
建议	xtable
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	hiReadsProcessor
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rSFFreader_0.30.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	rSFFreader_0.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rSFFreader
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rSFFreader
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rSFFreader/
包下载报告	下载数据