rmat
doi：10.18129/b9.bioc.rmat
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅rmat。
从MAT程序进行正常化和分析平铺阵列和芯片芯片数据的R实现。
生物导体版本：3.8
该软件包是包装垫的R版本，包含解析和合并Affymetrix bpmap和Cel瓷砖阵列文件（使用基于C ++的Fusion SDK和BioConductor软件包AFFXPARSER），使用序列特定模型从chip- chip- andect-flocect-芯片实验。注意：用户应安装GSL和GenomeGraphs。Windows用户：“请查阅源分布的Inst目录中可用的REDME文件，以获取必要的配置指令。Snow Leopard用户可以通过Grand Central Dispatch利用速度提高！
作者：Charles Cheung和Arnaud Droit和Raphael Gottardo
维护者：Arnaud droit
引用（从r内，输入引用（“ rmat”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ rmat”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ rmat”）
| R脚本 | RMAT用户指南 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 微阵列，，，，预处理，，，，软件 |
| 版本 | 3.32.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.4（R-2.9）（10年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 2.9.0），生物基因（> = 0.1.3），iranges（> = 1.13.10），生物酶（> = 2.15.1），affxparser |
| 进口 | 统计，方法，生物基因，，，，iranges，，，，生物酶，，，，affxparser，Stats4 |
| 链接 | |
| 建议 | 基因组，，，，rtracklayer |
| 系统要求 | GSL（GNU科学库） |
| 增强 | |
| URL | http://www.rglab.org |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | rmat_3.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | rmat_3.32.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rmat |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/rmat |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rmat/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
