rBiopaxParser

DOI:10.18129 / B9.bioc.rBiopaxParser

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见rBiopaxParser．

解析BioPax文件并用R表示

Bioconductor版本:3.8

解析BioPAX文件并用R表示，目前支持BioPAX级别2和级别3。

作者:弗兰克·克莱默

维护者:Frank Kramer

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("rBiopaxParser")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rBiopaxParser”)

PDF	R脚本	rBiopaxParser装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation，软件
版本	2.22.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(6年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.0.0)，data.table
进口	XML
链接
建议	Rgraphviz，RCurl，图，RUnit，BiocGenerics，nem，RBGL，igraph
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/frankkramer-lab/rBiopaxParser
全靠我
进口我	AnnotationHubData，pwOmics
建议我	AnnotationHub，NetPathMiner
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rBiopaxParser_2.22.0.tar.gz
Windows二进制	rBiopaxParser_2.22.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	rBiopaxParser_2.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rBiopaxParser
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rBiopaxParser
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rBiopaxParser/
软件包下载报告	下载数据