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qcmetrics
DOI:10.18129 / B9.bioc.qcmetrics
这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅qcmetrics。
一个质量控制的框架
Bioconductor版本:3.8
包提供了一个通用的数据质量控制的框架。它允许创建、管理和想象个人或组质量控制指标,在各种格式生成质量控制报告。
作者:洛朗与(aut (cre)
维修工:Laurent与< lg390在cam.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“qcmetrics”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“qcmetrics”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“qcmetrics”)
| HTML | R脚本 | 索引文件qcmetrics包装饰图案 |
| R脚本 | “qcmetrics”基础设施质量控制和报告 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ImmunoOncology,MassSpectrometry,微阵列,蛋白质组学,质量控制,ReportWriting,软件,可视化 |
| 版本 | 1.20.1 |
| Bioconductor自 | BioC 2.13 (r - 3.0)(5.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.3) |
| 进口 | Biobase、方法、knitr、工具、Nozzle.R1,xtable,老鸨,S4Vectors |
| 链接 | |
| 建议 | affy,MSnbase,ggplot2,晶格,yaqcaffy,MAQCsubsetAFX,RforProteomics,AnnotationDbi,mzR,hgu133plus2cdf,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/lgatto/qcmetrics |
| BugReports | https://github.com/lgatto/qcmetrics/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | MSstatsQC |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | qcmetrics_1.20.1.tar.gz |
| Windows二进制 | qcmetrics_1.20.1.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | qcmetrics_1.20.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qcmetrics |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ qcmetrics |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/qcmetrics/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
