plyranges

DOI:10.18129 / B9.bioc.plyranges

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅plyranges。

一个操纵GenomicRanges连贯接口

Bioconductor版本:3.8

dplyr-like界面相互作用的范围和GenomicRanges共同Bioconductor类。通过提供一个语法和一致的方式操纵这些类为新Bioconductor accessiblity用户是希望增加。

作者:斯图亚特·李(aut (cre),迈克尔·劳伦斯(aut,施莱)Dianne库克(aut,施莱)

维修工:斯图亚特·李<李。年代在wehi.edu.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“plyranges”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML	R脚本	介绍
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细节

biocViews	报道,DataRepresentation,基础设施,软件,WorkflowStep
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.5),方法,BiocGenerics,IRanges(> = 2.12.0),GenomicRanges(> = 1.28.4)
进口	dplyr,rlang(> = 0.2.0),magrittr,tidyr,tidyselect,rtracklayer,GenomicAlignments,GenomeInfoDb,Rsamtools,S4Vectors(> = 0.17.41),跑龙套
链接
建议	knitr,BiocStyle,rmarkdown,testthat,ggplot2,HelloRanges,HelloRangesData,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,pasillaBamSubset,covr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/sa-lee/plyranges
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	plyranges_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	plyranges_1.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	plyranges_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plyranges
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ plyranges
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/plyranges/
包下载报告	下载数据