oligoClasses

DOI:10.18129 / B9.bioc.oligoClasses

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见oligoClasses

oligo和crlmm支持的高吞吐量数组的类

Bioconductor版本:3.8

这个包包含oligo和crlmm包使用的类的定义、有效性检查和初始化方法。

作者:Benilton Carvalho和Robert Scharpf

维护者:Benilton Carvalho 和Robert Scharpf

引文(从R内,输入引用(“oligoClasses”)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("oligoClasses")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 基础设施软件
版本 1.44.0
在Bioconductor BioC 2.1 (R-2.6)(11.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.14)
进口 BiocGenerics(> = 0.27.1),Biobase(>= 2.17.8),方法,图形,IRanges(> = 2.5.17),GenomicRanges(> = 1.23.7),SummarizedExperimentBiostrings(> = 2.23.6),affyio(> = 1.23.2),ffforeachBiocManager跑龙套,S4Vectors(> = 0.9.25),RSQLiteDBI
链接
建议 hapmapsnp5hapmapsnp6pd.genomewidesnp.6pd.genomewidesnp.5pd.mapping50k.hind240pd.mapping50k.xba240pd.mapping250k.stypd.mapping250k.nspgenomewidesnp6Crlmm(> = 1.0.7),genomewidesnp5Crlmm(> = 1.0.6),RUnithuman370v1cCrlmmSNPchipVanillaICEcrlmm
SystemRequirements
增强了 doMCdoMPIdoSNOWdoParalleldoRedis
URL
全靠我 cn.farmscrlmmmaEndToEndmBPCR益生元pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoterpd.2006.07.18.mm8.refseq.promoterpd.2006.10.31.rn34.refseq.promoterpd.agpd.aragene.1.0.stpd.aragene.1.1.stpd.atdschip.tilingpd.ath1.121501pd.barley1pd.bovgene.1.0.stpd.bovgene.1.1.stpd.bovinepd.bsubtilispd.cangene.1.0.stpd.cangene.1.1.stpd.caninepd.canine.2pd.celeganspd.charm.hg18.examplepd.chickenpd.chigene.1.0.stpd.chigene.1.1.stpd.chogene.2.0.stpd.chogene.2.1.stpd.citruspd.clariom.d.humanpd.clariom.s.humanpd.clariom.s.human.htpd.clariom.s.mousepd.clariom.s.mouse.htpd.clariom.s.ratpd.clariom.s.rat.htpd.cottonpd.cyngene.1.0.stpd.cyngene.1.1.stpd.cyrgene.1.0.stpd.cyrgene.1.1.stpd.cytogenetics.arraypd.drogene.1.0.stpd.drogene.1.1.stpd.drosgenome1pd.drosophila.2pd.e.coli.2pd.ecolipd.ecoli.asv2pd.elegene.1.0.stpd.elegene.1.1.stpd.equgene.1.0.stpd.equgene.1.1.stpd.feinberg.hg18.me.hx1pd.feinberg.mm8.me.hx1pd.felgene.1.0.stpd.felgene.1.1.stpd.fingene.1.0.stpd.fingene.1.1.stpd.genomewidesnp.5pd.genomewidesnp.6pd.guigene.1.0.stpd.guigene.1.1.stpd.hc.g110pd.hg.focuspd.hg.u133.plus.2pd.hg.u133apd.hg.u133a.2pd.hg.u133a.tagpd.hg.u133bpd.hg.u219pd.hg.u95apd.hg.u95av2pd.hg.u95bpd.hg.u95cpd.hg.u95dpd.hg.u95epd.hg18.60mer.exprpd.ht.hg.u133.plus.pmpd.ht.hg.u133apd.ht.mg.430apd.hta.2.0pd.hu6800pd.huex.1.0.st.v2pd.hugene.1.0.st.v1pd.hugene.1.1.st.v1pd.hugene.2.0.stpd.hugene.2.1.stpd.maizepd.mapping250k.nsppd.mapping250k.stypd.mapping50k.hind240pd.mapping50k.xba240pd.margene.1.0.stpd.margene.1.1.stpd.medgene.1.0.stpd.medgene.1.1.stpd.medicagopd.mg.u74apd.mg.u74av2pd.mg.u74bpd.mg.u74bv2pd.mg.u74cpd.mg.u74cv2pd.mirna.1.0pd.mirna.2.0pd.mirna.3.0pd.mirna.3.1pd.mirna.4.0pd.moe430apd.moe430bpd.moex.1.0.st.v1pd.mogene.1.0.st.v1pd.mogene.1.1.st.v1pd.mogene.2.0.stpd.mogene.2.1.stpd.mouse430.2pd.mouse430a.2pd.mta.1.0pd.mu11ksubapd.mu11ksubbpd.nugo.hs1a520180pd.nugo.mm1a520177pd.ovigene.1.0.stpd.ovigene.1.1.stpd.pae.g1apd.plasmodium.anophelespd.poplarpd.porcinepd.porgene.1.0.stpd.porgene.1.1.stpd.rabgene.1.0.stpd.rabgene.1.1.stpd.rae230apd.rae230bpd.raex.1.0.st.v1pd.ragene.1.0.st.v1pd.ragene.1.1.st.v1pd.ragene.2.0.stpd.ragene.2.1.stpd.rat230.2pd.rcngene.1.0.stpd.rcngene.1.1.stpd.rg.u34apd.rg.u34bpd.rg.u34cpd.rhegene.1.0.stpd.rhegene.1.1.stpd.rhesuspd.ricepd.rjpgene.1.0.stpd.rjpgene.1.1.stpd.rn.u34pd.rta.1.0pd.rusgene.1.0.stpd.rusgene.1.1.stpd.s.aureuspd.soybeanpd.soygene.1.0.stpd.soygene.1.1.stpd.sugar.canepd.tomatopd.u133.x3ppd.vitis.viniferapd.wheatpd.x.laevis.2pd.x.tropicalispd.xenopus.laevispd.yeast.2pd.yg.s98pd.zebgene.1.0.stpd.zebgene.1.1.stpd.zebrafish彪马waveTiling
进口我 affycoretoolsArrayTV魅力frma斜体mimagerMinimumDistancepdInfoBuilder彪马SNPchipVanillaICE
建议我 BiocGenericshapmapsnp6
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 oligoClasses_1.44.0.tar.gz
Windows二进制 oligoClasses_1.44.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) oligoClasses_1.44.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/oligoClasses
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/oligoClasses
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/oligoClasses/
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