该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅NORMR。
生物导体版本:3.8
CHIP-seq和Chip-selike数据的强大归一化和差异调用程序。读数与用户指定数量的组件共同建模为二项式混合模型。合适的背景估算了某些地区富集的影响,因此代表了一个适当的零假设。这种健壮的背景用于识别显着丰富或耗尽的区域。
作者:Johannes Helmuth [AUT,CRE],Ho-Ryun Chung [aut]
维护者:Johannes Helmuth
引用(从r内,输入引用(“ normr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ normr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ normr”)
html | R脚本 | Normr包装简介 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结盟,,,,贝叶斯,,,,chipseq,,,,分类,,,,DataImport,,,,差异词,,,,功能基因组学,,,,遗传学,,,,多重组合,,,,正常化,,,,峰值探测,,,,预处理,,,,Ripseq,,,,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(2。5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 3.3.0) |
进口 | 方法,统计,utils,grdevices,并行,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,iranges,,,,RCPP(> = 0.11),QVALUE(> = 2.2),bamsignals(> = 1.4),rtracklayer(> = 1.32) |
链接 | RCPP |
建议 | 生物使用,,,,测试(> = 1.0),尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | C ++ 11 |
增强 | 生物比较 |
URL | https://github.com/your-highness/normr |
BugReports | https://github.com/your-highness/normr/issues |
取决于我 | |
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建议我 | |
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构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | normr_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | NORMR_1.8.0.ZIP |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | normr_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/normr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/normr |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/normr/ |
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