msgbsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.msgbsR

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见msgbsR．

msgbsR:甲基化敏感基因分型测序(MS-GBS) R功能

Bioconductor版本:3.8

用于MS-GBS实验分析的管道。

作者:本杰明·梅恩

维护者:Benjamin Mayne < Benjamin。梅恩在adelaide.edu.au>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("msgbsR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“msgbsR”)

PDF	R脚本	msgbsR_Example
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，DifferentialMethylation，表观遗传学，ImmunoOncology，MethylSeq，软件
版本	1.6.1
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.4)，GenomicRanges、方法
进口	BSgenome，easyRNASeq，刨边机，GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomeInfoDb，ggbio，ggplot2，IRanges平行,plyr，Rsamtools，R.utils统计数据,SummarizedExperiment，S4Vectors,跑龙套
链接
建议	roxygen2，BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn6
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	msgbsR_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	msgbsR_1.6.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	msgbsR_1.6.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msgbsR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/msgbsR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/msgbsR/
软件包下载报告	下载数据