M型

doi:10.18129/b9.bioc.mspurity

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅M型

对代谢组学中基于质谱的片段化的前体离子纯度的自动评估

生物导体版本:3.8

使用称为“前体纯度”的度量标准,评估目标前体在获得或预期的隔离窗口中的贡献。还为DI-MS数据提供了简单的处理步骤(平均,过滤,空白减法等)。适用于LC-MS(/MS)和DI-MS(/MS)数据。片段化光谱的光谱匹配也可以与库光谱的SQLITE数据库一起运行。

作者:Thomas N. Lawson,Ralf Weber,Martin Jones,Mark Viant,Warwick Dunn

维护者:thomas N. Lawson

引用(从r内,输入引用(“ M型”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mspurity”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Mspurity”)

html R脚本 M型
html R脚本 M型光谱匹配
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 免疫学,,,,质谱,,,,代谢组学,,,,软件
版本 1.8.1
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(2。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 RCPP
进口 plyr,,,,foreach, 平行,Dosnow,,,,Stringr,,,,MZR,,,,RESHAPE2,,,,快速积分,,,,GGPLOT2,,,,DBI,,,,rsqlite
链接
建议 测试,,,,XCMS,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,mspuritydata,,,,相机
系统要求
增强
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取决于我
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包装档案

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源包 mspurity_1.8.1.tar.gz
Windows二进制 mspurity_1.8.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) mspurity_1.8.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mspurity
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/mspurity
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/mspurity/
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