MotifMatchr
doi：10.18129/b9.bioc.motifmatchr
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅MotifMatchr。
r中的快速图案匹配
生物导体版本：3.8
快速找到许多主题和许多序列的主题匹配。由Pasi Rastas，Janne Korhonen和PetriMartinmäki开发的情绪主题库中的C ++代码。
作者：斯坦福大学艾丽西亚·施普[Aut，Cre] [CPH]
维护者：alicia schep
引用（从r内，输入引用（“ MotifMatchr”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ motifmatchr”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ motifmatchr”）
| html | R脚本 | MotifMatchr |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 图案，，，，软件 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（1。5年） |
| 执照 | GPL-3 +文件许可证 |
| 要看 | R（> = 3.3） |
| 进口 | 矩阵，，，，RCPP， 方法，TFBSTOOLS，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，基因组机，，，，iranges，，，，rsamtools，，，，GenomeInfodB |
| 链接 | RCPP，，，，rcpparmadillo |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
| 系统要求 | C ++ 11 |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | esatac |
| 建议我 | Chromvar |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | motifmatchr_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | motifmatchr_1.4.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | motifmatchr_1.4.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/motifmatchr |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/motifmatchr |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/motifmatchr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
