马赛克

DOI:10.18129 / B9.bioc.mosaics

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见马赛克．

mosaic(基于模型的ChIP-Seq单样本和双样本分析和推断)

Bioconductor版本:3.8

该软件包提供了MOSAiCS和MOSAiCS- hmm的拟合功能，MOSAiCS- hmm是一个统计框架，用于分析转录因子结合和组蛋白修饰的单样本或双样本ChIP-seq数据。

作者:钟东军，宽培芬，Rene Welch, Sunduz Keles

维护者:Dongjun Chung < Dongjun。钟在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("mosaics")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“马赛克”)

PDF	R脚本	马赛克
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学，ChIPseq，遗传学，测序，软件，转录
版本	2.20.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(8年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R(>= 3.0.0)，方法，图形，Rcpp
进口	质量样条函数,晶格，IRanges，GenomicRanges，GenomicAlignments，Rsamtools，GenomeInfoDb，S4Vectors
链接	Rcpp
建议	mosaicsExample
SystemRequirements	Perl
增强了	平行
URL	http://groups.google.com/group/mosaics_user_group
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	mosaics_2.20.0.tar.gz
Windows二进制	mosaics_2.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	mosaics_2.20.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosaics
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mosaic
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mosaics/
软件包下载报告	下载数据