missRows

DOI:10.18129 / B9.bioc.missRows

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见missRows

多组学数据集成中缺失个体的处理

Bioconductor版本:3.8

missRows包实现了MI-MFA方法,以处理多组学数据集成中缺失的个体(“生物单位”)。MI-MFA方法从多因素分析模型中生成多个估算数据集,然后在单个共识解决方案中组合产量结果。该包提供了用于估计个体和变量的坐标,估算缺失个体的函数,以及各种诊断图,以检查缺失的模式,并可视化由于缺失值造成的不确定性。

作者:Ignacio Gonzalez和Valentin Voillet

维护者:Gonzalez Ignacio < Ignacio。冈萨雷斯在bbox.fr>

引文(从R内,输入引用(“missRows”)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("missRows")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“missRows”)

PDF R脚本 missRows
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DimensionReductionMathematicalBiologyPrincipalComponent软件StatisticalMethod可视化
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(一年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 3.5),方法,ggplot2grDevices,MultiAssayExperiment
进口 plyr统计数据,gtoolsS4Vectors
链接
建议 BiocStyleknitrtestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 missRows_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 missRows_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) missRows_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/missRows
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/missRows
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/missRows/
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