这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见mAPKL.
Bioconductor版本:3.8
我们提出了一种混合FS方法(mAP-KL),它结合了多重假设检验和亲和传播(AP)聚类算法以及Krzanowski & Lai聚类质量指数,以选择一个小而有信息的基因子集。
作者:Argiris Sakellariou
维护者:Argiris Sakellariou
引文(从R内,输入引用(“mAPKL”)
):
要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("mAPKL")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“mAPKL”)
R脚本 | mAPKL教程 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,FeatureExtraction,GeneExpression,微阵列,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(4年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.2.0),Biobase |
进口 | 乘,clusterSim,apcluster,limma,e1071,AnnotationDbi、方法、parmigene,igraph,reactome.db |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,mAPKLData,hgu133plus2.db,RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | mAPKL_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | mAPKL_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | mAPKL_1.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mAPKL |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mAPKL |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/mAPKL/ |
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