这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见lpNet.
Bioconductor版本:3.8
lpNet旨在推断生物网络,特别是信号和基因网络。为此,它以稳态或时间序列扰动数据作为输入,并生成一个允许信号网络推断的LP模型。对于参数识别,可以使用省略一次交叉验证或分层n倍交叉验证。
作者:贝蒂娜·纳普,玛尔塔·r·a·马托斯,约翰娜·马祖尔,拉尔斯·卡德拉利
维护者:Lars Kaderali < Lars。Kaderali在tu-dresden.de>
引文(从R内,输入引用(“lpNet”)
):
要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("lpNet")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“lpNet”)
R脚本 | lpNet,网络推理用线性优化程序。 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | NetworkInference,软件 |
版本 | 2.14.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(6年) |
许可证 | 艺术许可2.0 |
取决于 | lpSolve,nem |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | lpNet_2.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | lpNet_2.14.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | lpNet_2.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lpNet |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/lpNet |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/lpNet/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |