lpNet

DOI:10.18129 / B9.bioc.lpNet

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见lpNet．

网络推理的线性规划模型

Bioconductor版本:3.8

lpNet旨在推断生物网络，特别是信号和基因网络。为此，它以稳态或时间序列扰动数据作为输入，并生成一个允许信号网络推断的LP模型。对于参数识别，可以使用省略一次交叉验证或分层n倍交叉验证。

作者:贝蒂娜·纳普，玛尔塔·r·a·马托斯，约翰娜·马祖尔，拉尔斯·卡德拉利

维护者:Lars Kaderali < Lars。Kaderali在tu-dresden.de>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("lpNet")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“lpNet”)

PDF	R脚本	lpNet，网络推理用线性优化程序。
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	NetworkInference，软件
版本	2.14.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(6年)
许可证	艺术许可2.0
取决于	lpSolve，nem
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	lpNet_2.14.0.tar.gz
Windows二进制	lpNet_2.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	lpNet_2.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lpNet
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/lpNet
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/lpNet/
软件包下载报告	下载数据