keggorthology

DOI:10.18129 / B9.bioc.keggorthology

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅keggorthology。

图支持KO, KEGG Orthology

Bioconductor版本:3.8

2010年2月的图形表示KEGG Orthology。IDs的KEGG orthology是一组路径不混淆和KEGG直接同源id。

作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“keggorthology”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“keggorthology”)

PDF	R脚本	keggorthology概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	GraphAndNetwork,KEGG,通路,软件,可视化
版本	2.34.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(9年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.5.0),统计数据,图,hgu95av2.db
进口	AnnotationDbi,图,DBI,图、grDevices方法、统计工具,跑龙套
链接
建议	RBGL,所有
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	MLInterfaces
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	keggorthology_2.34.0.tar.gz
Windows二进制	keggorthology_2.34.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	keggorthology_2.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/keggorthology
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ keggorthology
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/keggorthology/
包下载报告	下载数据