ImageHts

doi:10.18129/b9.bioc.imagehts

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅ImageHts

高通量显微镜筛选的分析

生物导体版本:3.8

ImageHTS是一个用于分析高通量显微镜屏幕的R软件包。该软件包提供了一个模块化且可扩展的框架,可用于细分单元格,提取定量单元格特征,预测单元格类型并通过Web界面浏览屏幕数据。ImageHT旨在在分布式环境中运行,提供了对远程数据的标准化访问,并促进了基于高通量显微镜数据集的传播。

作者:Gregoire Pau,Xian Zhang,Michael Boutros,Wolfgang Huber

维护者:约瑟夫·巴里(Joseph Barry)

引用(从r内,输入引用(“ ImageHts”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ imageHts”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ ImageHts”)

PDF R脚本 用ImageHTS分析高通量显微镜的屏幕
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,免疫学,,,,预处理,,,,软件,,,,可视化
版本 1.32.1
在生物导体中 Bioc 2.7(R-2.12)(8。5年)
执照 LGPL-2.1
要看 r(> = 2.9.0),ebimage(> = 4.3.12),CellHTS2(> = 2.10.0)
进口 工具,生物酶,,,,HWRITER, 方法,VSN,统计,utils,E1071
链接
建议 生物使用,,,,大量的
系统要求
增强
URL
取决于我 PGPC
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ImageHTS_1.32.1.tar.gz
Windows二进制 ImageHTS_1.32.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) ImageHTS_1.32.1.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/imagehts
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/imagehts
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/imagehts/
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