该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅ImageHts。
生物导体版本:3.8
ImageHTS是一个用于分析高通量显微镜屏幕的R软件包。该软件包提供了一个模块化且可扩展的框架,可用于细分单元格,提取定量单元格特征,预测单元格类型并通过Web界面浏览屏幕数据。ImageHT旨在在分布式环境中运行,提供了对远程数据的标准化访问,并促进了基于高通量显微镜数据集的传播。
作者:Gregoire Pau,Xian Zhang,Michael Boutros,Wolfgang Huber
维护者:约瑟夫·巴里(Joseph Barry)
引用(从r内,输入引用(“ ImageHts”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ imageHts”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ ImageHts”)
R脚本 | 用ImageHTS分析高通量显微镜的屏幕 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 蜂窝基,,,,免疫学,,,,预处理,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.32.1 |
在生物导体中 | Bioc 2.7(R-2.12)(8。5年) |
执照 | LGPL-2.1 |
要看 | r(> = 2.9.0),ebimage(> = 4.3.12),CellHTS2(> = 2.10.0) |
进口 | 工具,生物酶,,,,HWRITER, 方法,VSN,统计,utils,E1071 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,大量的 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | PGPC |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ImageHTS_1.32.1.tar.gz |
Windows二进制 | ImageHTS_1.32.1.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | ImageHTS_1.32.1.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/imagehts |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/imagehts |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/imagehts/ |
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