igvR

DOI:10.18129 / B9.bioc.igvR

此包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见igvR．

综合基因组学查看器

Bioconductor版本:3.8

访问igv.js，在web浏览器中运行的综合基因组学查看器。

作者:保罗·香农

维护者:Paul Shannon < Paul .thurmond。香农在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“igvR”)

超文本标记语言	R脚本	igvR:对igv.js的编程访问，这是一个基于浏览器的基因组跟踪查看器
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	GenomeBrowsers，软件，ThirdPartyClient，可视化
版本	1.2.0
在Bioconductor公司	BioC 3.7 (R-3.5)(1年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.5.0)，GenomicRanges，VariantAnnotation，rtracklayer，BrowserViz(> = 2.0)
进口	方法,BiocGenerics，httpuv,跑龙套
链接
建议	RUnit，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	igvR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	igvR_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	igvR_1.2.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/igvR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/igvR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/igvR/
软件包下载报告	下载数据