理想的
doi：10.18129/b9.bioc.deal
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅理想的。
交互式差异表达分析
生物导体版本：3.8
该软件包为RNA序列数据集的交互式差分表达分析提供了功能，以快速有效地提取下游差异表达的步骤。闪亮的应用程序封装了整个软件包。
作者：费德里科·马里尼（Federico Marini）[AUT，CRE]
维护者：uni-mainz.de>的Federico Marini
引用（从r内，输入引用（“理想”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“理想”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“理想”）
| html | R脚本 | 理想用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，GUI，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，免疫学，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，报告写作，，，，测序，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.6.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.5（R-3.4）（2年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
| 要看 | topgo |
| 进口 | deseq2，，，，总结性特征，，，，基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，GGPLOT2（> = 2.0.0），D3 -HeatMap，，，，pheatmap，，，，PCAEXPLORER，，，，ihw，，，，GPLOTS，，，，insctr，，，，Goseq，，，，Stringr，，，，dplyr，，，，林玛，，，，gostats，，，，go.db，，，，AnnotationDbi，，，，闪亮的（> = 0.12.0），发光的dashboard，，，，丝绸，，，，DT，，，，Rentrez，，，，Rintrojs，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，闪亮，，，，生物比较，grdevices，方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，生物使用，，，，呼吸道，，，，org.hs.eg.db，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown，，，，变形，，，，EDGER |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/federicomarini/idealhttps://federicomarini.github.io/ideal/ |
| BugReports | https://github.com/federicomarini/ideal/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Ideal_1.6.1.tar.gz |
| Windows二进制 | Ideal_1.6.1.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Ideal_1.6.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ideal |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/理想 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ideal/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
