gwascat

DOI:10.18129 / B9.bioc.gwascat

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见gwascat．

在EMBL-EBI GWAS目录中表示和建模数据

Bioconductor版本:3.8

在EMBL-EBI GWAS目录中表示和建模数据。

作者:VJ Carey

维护者:VJ Carey

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("gwascat")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“gwascat”)

PDF	R脚本	gwascat—探索NHGRI GWAS目录
超文本标记语言	R脚本	gwascat—EBI目录中GWAS命中的GRanges
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	遗传学，软件
版本	2.14.0
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(7年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5.0)，Homo.sapiens
进口	方法,BiocGenerics，S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges(> = 1.29.6),snpStats，Biostrings，Rsamtools，rtracklayer，gQTLstats，Gviz，VariantAnnotation，AnnotationHub，AnnotationDbi，GenomicFeatures，图，ggbio，ggplot2，SummarizedExperiment
链接
建议	DO.db，DT跑龙套,knitr，RBGL，RUnit
SystemRequirements
增强了	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37
URL
全靠我	liftOver，vtpnet
进口我
建议我	GenomicScores，gQTLBase，gQTLstats，grasp2db，hmdbQuery，TFutils
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	gwascat_2.14.0.tar.gz
Windows二进制	gwascat_2.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	gwascat_2.14.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwascat
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gwascat
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gwascat/
软件包下载报告	下载数据