genomeIntervals

DOI:10.18129 / B9.bioc.genomeIntervals

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅genomeIntervals。

基因操作的间隔

Bioconductor版本:3.8

这个包定义类代表基因间隔和提供了使用这些函数和方法。注:包提供了基本的基础设施,增强由包“girafe”。

作者:朱利安Gagneur genzentrum.lmu.de > < Gagneur, Joern Toedling,理查德•Bourgon尼古拉斯Delhomme

维护人员:朱利安Gagneur < Gagneur在genzentrum.lmu.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“genomeIntervals”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“genomeIntervals”)

PDF	R脚本	genomeIntervals包的概述。
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,遗传学,基础设施,软件
版本	1.38.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (r - 2.9)(10年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.15.0)、方法时间间隔(> = 0.14.0),BiocGenerics(> = 0.15.2)
进口	GenomeInfoDb(> = 1.5.8),GenomicRanges(> = 1.21.16),IRanges(> = 2.3.14),S4Vectors(> = 0.7.10)
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	girafe
进口我	easyRNASeq
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	genomeIntervals_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	genomeIntervals_1.38.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	genomeIntervals_1.38.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomeIntervals
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ genomeIntervals
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genomeIntervals/
包下载报告	下载数据