geneAttribution

DOI:10.18129 / B9.bioc.geneAttribution

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅geneAttribution。

识别候选基因与基因变异有关

Bioconductor版本:3.8

识别的最可能的基因或基因变异在给定基因位点在人类基因组中行为。最基本的功能假设基因输入轨迹越近,越有可能是诱发的基因。此外,任何经验数据链接基因组区域的基因(如eQTL或基因组构造数据)可以使用如果UCSC的请全部文件格式提供。

作者:亚瑟香肠

维护人员:亚瑟香肠< wustera gene.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“geneAttribution”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“geneAttribution”)

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文本		新闻

细节

biocViews	GenePrediction,GenomeWideAssociation,GenomicVariation,单核苷酸多态性,软件,VariantAnnotation
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	跑龙套,GenomicRanges,org.Hs.eg.db,BiocGenerics,GenomeInfoDb,GenomicFeatures,IRanges,rtracklayer
链接
建议	TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	geneAttribution_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	geneAttribution_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	geneAttribution_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geneAttribution
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ geneAttribution
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/geneAttribution/
包下载报告	下载数据