啪嗒啪嗒地响

DOI:10.18129 / B9.bioc.flipflop

这个包是Bioconductor的3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参阅啪嗒啪嗒地响。

作为流动问题的基于lasso的异构体快速预测

Bioconductor版本:3.8

flipflops根据RNA-Seq读取数据，发现给定样本中表达的基因亚型及其丰度。它以SAM格式的对齐文件作为输入。它还可以同时从几个样本中发现转录本，增加统计能力。

作者:Elsa Bernard, Laurent Jacob, Julien Mairal和Jean-Philippe Vert

维护人员:Elsa Bernard < Elsa。伯纳德在mines-paristech.fr >

安装

要安装这个包，启动R(版本"3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("flipflop")

对于旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的这个包的版本文档，启动R并输入:

browseVignettes(“触发器”)

PDF	R脚本	触发器:快速基于lasso的异构体预测作为一个流动问题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,RNASeq,RNASeqData,回归,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (R-3.0)(5.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10.0)
进口	方法,矩阵,IRanges,GenomicRanges、并行
链接
建议	GenomicFeatures
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL	http://cbio.ensmp.fr/flipflop
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在你的R会话中使用这个包的说明。

源包	flipflop_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	flipflop_1.20.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	flipflop_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flipflop
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/啪嗒啪嗒地响
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flipflop/
包下载报告	下载数据