这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅esetVis。
Bioconductor版本:3.8
效用函数的可视化expressionSet(或SummarizedExperiment) Bioconductor对象,包括光谱图、tsne和线性判别分析。静态图通过ggplot2包或互动通过ggvis rbokeh包是可用的。
作者:罗兰Cougnaud <罗兰。在openanalytics.eu cougnaud >
Laure Cougnaud维护者:<罗兰。在openanalytics.eu cougnaud >
从内部引用(R,回车引用(“esetVis”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“esetVis”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“esetVis”)
HTML | R脚本 | esetVis包 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataRepresentation,DimensionReduction,通路,PrincipalComponent,软件,可视化 |
版本 | 1.8.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(2.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | |
进口 | mpm,hexbin,Rtsne,中长期规划、网格Biobase,质量统计,跑龙套,grDevices方法 |
链接 | |
建议 | ggplot2,ggvis,rbokeh,ggrepel,knitr,rmarkdown,所有,hgu95av2.db,AnnotationDbi,老鸨,SummarizedExperiment |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | esetVis_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | esetVis_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | esetVis_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/esetVis |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ esetVis |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/esetVis/ |
包下载报告 | 下载数据 |