epivizrChart

DOI:10.18129 / B9.bioc.epivizrChart

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅epivizrChart。

R epiviz web组件的接口

Bioconductor版本:3.8

这个包提供了一个API使用epiviz基因组数据的交互式可视化的web组件。对象/ BioConductor可以用于生成交互式R减价R /笔记本文件或可以可视化工作室的默认浏览器。

作者:布莱恩·戈特弗里德(aut) Jayaram Kancherla (aut),赫克托耳Corrada布拉沃(aut (cre)

维修工:赫克托耳Corrada布拉沃< hcorrada gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“epivizrChart”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“epivizrChart”)

HTML	R脚本	介绍epivizrChart
HTML	R脚本	使用epivizrChart可视化“RangeSummarizedExperiment”对象的应用程序
HTML	R脚本	可视化文件epivizrChart
HTML	R脚本	可视化在闪亮的应用程序使用epivizrChart基因组数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GUI,软件,可视化
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	epivizrData(> = 1.5.1),epivizrServer,htmltools,rjson、方法、BiocGenerics
链接
建议	testthat,roxygen2,knitr,Biobase,GenomicRanges,S4Vectors,IRanges,SummarizedExperiment,antiProfilesData,hgu133plus2.db,Mus.musculus,BiocStyle,Homo.sapiens,闪亮的,minfi,Rsamtools,rtracklayer,RColorBrewer,magrittr,AnnotationHub
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	epivizrChart_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	epivizrChart_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	epivizrChart_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizrChart
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ epivizrChart
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/epivizrChart/
包下载报告	下载数据