eisa

DOI:10.18129 / B9.bioc.eisa

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅eisa。

通过迭代签名算法表达数据分析

Bioconductor版本:3.8

迭代签名算法(ISA)是一个biclustering方法;找到相关的块(转录模块)基因表达的数据(或其他表格)。ISA能够找到重叠模块和噪音是有弹性的。这个包提供了一个方便的ISA接口,使用标准BioConductor数据结构;也包含各种可视化工具,可以用于其他biclustering算法。

作者:伽柏Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >

维护人员:伽柏Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(eisa)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (eisa)

PDF	R脚本	基因表达数据的迭代签名算法
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类,GeneExpression,微阵列,软件,可视化
版本	1.34.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(9年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	isa2,Biobase(> = 2.17.8),AnnotationDbi、方法
进口	BiocGenerics,类别,genefilter,DBI
链接
建议	igraph(> = 0.6),矩阵,GOstats,GO.db,KEGG.db,biclust,质量,xtable,所有,hgu95av2.db,targetscan.Hs.eg.db,org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	ExpressionView
进口我	ExpressionView
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	eisa_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	eisa_1.34.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	eisa_1.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eisa
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ eisa
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/eisa/
包下载报告	下载数据