dyebias

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅dyebias。

GASSCO方法为纠正slide-dependent gene-specific染料的偏见

Bioconductor版本:3.8

很多双色杂交过程受到一种染料gene-specific和slide-specific偏见。前者取决于核苷酸用于标签的内容;后者取决于标签百分比。slide-dependency至今没有公认,解决人工制品是不可能的。鉴于dye-swapped双杂交过程的一个合理的数量,或相同的和相同的杂交过程的基因和slide-biases使用GASSCO方法可以估计和修正(Margaritis et al .,摩尔系统。生物5:266 (2009),doi: 10.1038 / msb.2009.21)

作者:菲利普Lijnzaad Thanasis Margaritis

维护人员:菲利普Lijnzaad < plijnzaad gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“dyebias”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“dyebias”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF	R脚本	染料偏差纠正
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel
版本	1.42.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (r - 2.9)(10年)