dSimer

DOI:10.18129 / B9.bioc.dSimer

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅dSimer。

集成相似疾病的方法

Bioconductor版本:3.8

dSimer 9 R包提供计算方法测量disease-disease相似,包括一个标准的余弦相似性度量和八个基于函数的方法。疾病相似矩阵获得这九个方法可以通过热图可视化和网络。生物数据广泛用于disease-disease关联研究也由dSimer提供。

作者:李敏<港mail.csu.edu.cn >,彭倪< nipeng csu.edu.cn >黄来自范Zhihui和萍。

维护人员:彭倪< nipeng csu.edu.cn >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“dSimer”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“dSimer”)

HTML	R脚本	集成相似疾病的方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	网络,软件,可视化
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(2.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.3.0),igraph(> = 1.0.1)
进口	统计数据,Rcpp(> = 0.11.3),ggplot2,reshape2,GO.db,org.Hs.eg.db,AnnotationDbi、图形
链接	Rcpp
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	dSimer_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	dSimer_1.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	dSimer_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dSimer
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ dSimer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/dSimer/
包下载报告	下载数据