共识

doi:10.18129/b9.bioc.consensusseeker

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅共识

使用基因组位置和基因组范围的一组经验中的共识区域检测

生物导体版本:3.8

该软件包比较了基因组位置和基因组范围,从多个实验提取共同区域。分析区域的大小是可调的,以及必须在潜在区域中存在特征以将该区域标记为共识区域的经验数量。

作者:Astrid Deschenes [CRE,AUT],Fabien Claude Lamaze [CTB],Pascal Belleau [aut],Arnaud Droit [aut]

维护者:Astrid Deschenes >

引用(从r内,输入引用(“共识”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“共识”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“共识”)

html R脚本 检测一组实验内的共识区域
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 生物问题,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,遗传学,,,,多重组合,,,,峰值探测,,,,测序,,,,软件,,,,转录
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(3年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.10),生物基因,,,,iranges,,,,基因组机,,,,生物比较
进口 GenomeInfodB,,,,rtracklayer,,,,Stringr,,,,S4VECTORS, 方法
链接
建议 生物使用,,,,GGPLOT2,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,运行
系统要求
增强
URL https://github.com/arnauddroitlab/consensusseeker
BugReports https://github.com/arnauddroitlab/consensusseeker/issues
取决于我
进口我 RJMCMCN核小体
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 CONSENSUSSEEKER_1.10.0.TAR.GZ
Windows二进制 共识Seeker_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) CONSENSUSSEEKER_1.10.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/consensusseeker
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/共识者
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/consensusseeker/
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