condcomp

DOI:10.18129 / B9.bioc.condcomp

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅condcomp。

条件比较scRNA-seq数据

Bioconductor版本:3.8

对于一个给定的集群数据,也可以分成两个条件,这个包提供了一种方法来表示集群上执行一个条件比较数据。在每个集群上执行比较。使用和一些统计数据,分析结合在一起使用时,可能会给一些见解的异质性的集群。

作者:•迪奥戈p·p·布兰科(aut (cre)

维护人员:•迪奥戈p·p·布兰科< diogo.pp。布兰科在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“condcomp”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“condcomp”)

HTML	R脚本	与condcomp scRNA-seq数据异质性
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	聚类,ImmunoOncology,SingleCell,软件,可视化
版本	1.0.1
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(0.5年)
许可证	GPL许可证(> = 2)|文件
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	集群,ggplot2,ggrepel,离群值
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,矩阵,修拉,单片眼镜,HSMMSingleCell
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	condcomp_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	condcomp_1.0.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	condcomp_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/condcomp
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ condcomp
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/condcomp/
包下载报告	下载数据