cobindR

DOI:10.18129 / B9.bioc.cobindR

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cobindR。

发现共现图案的转录因子结合位点

Bioconductor版本:3.8

发现和分析共现图案组基因的转录因子结合位点

作者:曼Benary, Stefan Kroeger Yuehien李,罗伯特·莱曼

维护人员:曼Benary <曼。在cms.hu-berlin.de benary >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cobindR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cobindR”)

PDF	R脚本	使用cobindR
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文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology,ChIPSeq,MultipleComparison,SequenceMatching,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	方法,seqinr,yaml,rtfbs,gplots,mclust,gmp,BiocGenerics(> = 0.13.8),IRanges,Biostrings,BSgenome,biomaRt
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了	rGADEM,seqLogo,genoPlotR平行,维恩图,RColorBrewer,vcd,MotifDb,降雪
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cobindR_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	cobindR_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	cobindR_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cobindR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cobindR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cobindR/
包下载报告	下载数据