cghMCR

DOI:10.18129 / B9.bioc.cghMCR

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cghMCR。

发现染色体区域显示共同收益/损失

Bioconductor版本:3.8

这个包提供了函数来识别基因组区域的利益基于分段拷贝数的数据来自多个样本。

作者:j .张和b。冯

维护人员:张j . < jzhang jimmy.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cghMCR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cghMCR”)

PDF	R脚本	cghMCR findMCR
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation,微阵列,软件
版本	1.40.0
Bioconductor自	BioC 1.8 (r - 2.3)(13岁)
许可证	LGPL
取决于	方法,DNAcopy,CNTools,limma
进口	BiocGenerics(> = 0.1.6),stats4
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cghMCR_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	cghMCR_1.40.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	cghMCR_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cghMCR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cghMCR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cghMCR/
包下载报告	下载数据