cellbaseR

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellbaseR

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cellbaseR。

从网络高性能Cellbase查询注释数据

Bioconductor版本:3.8

这个R包使用的详尽的RESTful Web服务API Cellabase数据库实现。它使研究人员能够查询和获得丰富的生物信息从一个数据库节省很多时间。另一个好处是,研究人员可以很容易地对不同的生物主题进行查询和链接所有这些信息集成的所有信息。

作者:穆罕默德OE阿卜杜拉

维护人员:穆罕默德OE阿卜杜拉< melsiddieg gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cellbaseR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cellbaseR”)

HTML	R脚本	简化基因组注释在R
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,软件,VariantAnnotation
版本	1.6.1
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(2年)
许可证	Apache许可(= = 2.0)
取决于	R (> = 3.4)
进口	方法,jsonlite,httr,data.table,pbapply,tidyr,R.utils,Rsamtools,BiocParallel,foreach跑龙套,平行,doParallel
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,Gviz,VariantAnnotation
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/melsiddieg/cellbaseR
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cellbaseR_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	cellbaseR_1.6.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	cellbaseR_1.6.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellbaseR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cellbaseR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cellbaseR/
包下载报告	下载数据