CTRAP
doi：10.18129/b9.bioc.ctrap
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅CTRAP。
鉴定来自差异基因表达数据的候选因果扰动
生物导体版本：3.8
比较差异基因表达与来自已知细胞扰动（例如敲低的基因敲低，过表达或小分子）的结果。这种分析不仅可以推断基因表达差异的分子原因，而且还可以鉴定出可以驱动或恢复特定转录组改变的小分子。
作者：Bernardo P. de Almeida [AUT]，Nuno Saraiva-Agostinho [AUT，CRE]，Nuno L. Barbosa-Morais [AUT，LED]
维护者：nuno saraiva-agostinho
引用（从r内，输入引用（“ ctrap”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ ctrap”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ ctrap”）
| html | R脚本 | CTRAP：DGE与细胞扰动的比较 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，途径，，，，rnaseq，，，，软件，，，，转录组学 |
| 版本 | 1.0.3 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（0.5岁） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
| 要看 | R（> = 3.5.0） |
| 进口 | Data.Table，，，，林玛，统计fgsea，，，，pbapply，，，，plyr，，，，牛仔图，，，，GGPLOT2，，，，RHDF5，，，，r.utils，，，，httr， 方法，钢琴，，，，readr，utils，图形 |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，COVR，，，，Biomart |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/nuno-agostinho/ctrap |
| BugReports | https://github.com/nuno-agostinho/ctrap/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ctrap_1.0.3.3.tar.gz |
| Windows二进制 | ctrap_1.0.3.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | ctrap_1.0.3.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ctrap |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/ctrap |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ctrap/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
