Birte
doi：10.18129/b9.bioc.birte
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅Birte。
贝叶斯对调控对表达的影响（BIRTE）的推断
生物导体版本：3.8
mRNA分子的表达水平由不同的过程调节，包括转录因子的抑制或激活，并通过microRNAS进行转录后降解。Birte使用TFS，miRNA和可能其他因素的调节网络以及mRNA，miRNA和其他可用表达数据来预测调节剂对其靶基因表达的相对影响。推理是在使用Markov-Chain-Monte-Carlo的贝叶斯建模框架中进行的。一个特殊功能是在主动调节器之间进行后续网络反向工程的可能性。
作者：Holger Froehlich，Benedikt Zacher的贡献
维护者：holger froehlich
引用（从r内，输入引用（“ Birte”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ birte”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Birte”）
| R脚本 | 贝叶斯对转录活性调节的推断 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 读书我 |
细节
| 生物浏览 | 贝叶斯，，，，基因表达，，，，微阵列，，，，网络，，，，网络引导，，，，回归，，，，测序，，，，软件，，，，转录 |
| 版本 | 1.18.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（4年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.0.0），rcpparmadillo（> = 0.3.6.1），RCPP |
| 进口 | 大量的，，，，林玛（> = 3.22.0），Glmnet，，，，生物酶，，，，NEM，图形，统计，utils |
| 链接 | rcpparmadillo，，，，RCPP |
| 建议 | 尼特 |
| 系统要求 | Blas，拉帕克 |
| 增强 | rgraphviz |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Birte_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | birte_1.18.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Birte_1.18.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/birte |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/birte |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/birte/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
