biosigner

DOI:10.18129 / B9.bioc.biosigner

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见biosigner

从组学数据中发现特征

Bioconductor版本:3.8

特征选择在组学数据分析中至关重要,可以从复杂的高维数据中提取受限的、有意义的分子特征,并构建健壮的分类器。这个包实现了一种新的方法来评估变量与分类器预测性能的相关性。该方法可以与PLS-DA、随机森林和SVM二元分类器并行运行。返回签名和相应的“受限”模型,从而实现对新数据集的未来预测。在Workflow4metabolomics.org的计算代谢组学在线基础设施中可以获得该包的Galaxy实现。

作者:Philippe Rinaudo <博士。rinaudo在gmail.com>, Etienne Thevenot < Etienne。Thevenot at cea.fr>

维护者:Philippe Rinaudo <博士。rinaudo在gmail.com>, Etienne Thevenot < Etienne。Thevenot at cea.fr>

引文(从R内,输入引用(“biosigner”)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("biosigner")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“biosigner”)

超文本标记语言 R脚本 装饰图案的标题
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 分类FeatureExtractionLipidomics代谢组学蛋白质组学软件转录组
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(3年)
许可证 CeCILL
取决于
进口 方法,e1071randomForestroplsBiobase
链接
建议 BioMarkRUnitBiocGenericsBiocStylegolubEsetshu6800.dbknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 biosigner_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 biosigner_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) biosigner_1.10.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biosigner
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/biosigner
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/biosigner/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网