该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅Biomart。
生物导体版本:3.8
近年来,公共数据存储库已获得大量生物学数据。对于全面的生物信息学数据分析,需要轻松访问这些有价值的数据资源和与数据分析的公司集成。BIOMART提供了越来越多的数据库集合的接口,该数据库实施了Biomart软件套件(http://www.biomart.org)。该软件包可以以统一的方式检索大量数据,而无需了解基础数据库模式或编写复杂的SQL查询。BiomArt数据库中最突出的示例是Ensembl,它为BiomArt用户提供了直接访问一组数据集的访问,并启用了从基因注释到数据库挖掘的广泛强大的在线查询。
作者:Steffen Durinck [Aut],Wolfgang Huber [AUT],Sean Davis [CTB],Francois Pepin [CTB],Vince S Buffalo [CTB],Mike Smith [CTB,CRE]
维护者:迈克·史密斯(Mike Smith)
引用(从r内,输入引用(“ Biomart”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ biomart”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Biomart”)
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文本 | 消息 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | biomart_2.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | biomart_2.38.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | biomart_2.38.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biomart |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/biomart |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/biomart/ |
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